Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms