Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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Cops9Q3U898 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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Cops9Q3U898 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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Cops9Q3U898 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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Cops9Q3U898 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Cops9Q3U898 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Cops9Q3U898 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Cops9Q3U898 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Cops9Q3U898 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cops9Q3U898 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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Cops9Q3U898 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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