Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13499-201ENSMUST00000142804 603 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r210-201ENSMUST00000072044 921 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Gtpbp6Q3U6U5 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
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Gtpbp6Q3U6U5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
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Gtpbp6Q3U6U5 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Gtpbp6Q3U6U5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
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Gtpbp6Q3U6U5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms