Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gse1Q3U3C9 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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