Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Kdm4dQ3U2K5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Kdm4dQ3U2K5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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