Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms