Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ctdnep1Q3TP92 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ctdnep1Q3TP92 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ctdnep1Q3TP92 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms