Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc102aQ3TMW1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms