Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms