Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms