Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna5Q2MKA5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms