Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Fam178bQ24JP3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Fam178bQ24JP3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Fam178bQ24JP3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Fam178bQ24JP3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Fam178bQ24JP3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Fam178bQ24JP3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Fam178bQ24JP3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Fam178bQ24JP3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Fam178bQ24JP3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Fam178bQ24JP3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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