Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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