Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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ptchd1Q14B62 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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ptchd1Q14B62 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ptchd1Q14B62 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ptchd1Q14B62 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ptchd1Q14B62 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ptchd1Q14B62 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ptchd1Q14B62 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ptchd1Q14B62 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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ptchd1Q14B62 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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ptchd1Q14B62 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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ptchd1Q14B62 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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ptchd1Q14B62 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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