Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms