Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Traf3ip1Q149C2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Traf3ip1Q149C2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms