Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r181Q0P547 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms