Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms