Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms