Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms