Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MestQ07646 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MestQ07646 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms