Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms