Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms