Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms