Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms