Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GscQ02591 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GscQ02591 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GscQ02591 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GscQ02591 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GscQ02591 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GscQ02591 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GscQ02591 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GscQ02591 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GscQ02591 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GscQ02591 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GscQ02591 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GscQ02591 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GscQ02591 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GscQ02591 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GscQ02591 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GscQ02591 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GscQ02591 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GscQ02591 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GscQ02591 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GscQ02591 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GscQ02591 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GscQ02591 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GscQ02591 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GscQ02591 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GscQ02591 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GscQ02591 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GscQ02591 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GscQ02591 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GscQ02591 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GscQ02591 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GscQ02591 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GscQ02591 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GscQ02591 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GscQ02591 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GscQ02591 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GscQ02591 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GscQ02591 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GscQ02591 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GscQ02591 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GscQ02591 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GscQ02591 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GscQ02591 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GscQ02591 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GscQ02591 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GscQ02591 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GscQ02591 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GscQ02591 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GscQ02591 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GscQ02591 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GscQ02591 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GscQ02591 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GscQ02591 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GscQ02591 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GscQ02591 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GscQ02591 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GscQ02591 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GscQ02591 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GscQ02591 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GscQ02591 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GscQ02591 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GscQ02591 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GscQ02591 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GscQ02591 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GscQ02591 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms