Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Zfp39Q02525 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms