Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms