Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2aQ01320 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms