Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col1a2Q01149 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms