Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms