Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms