Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms