Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms