Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms