Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3aP97351 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms