Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms