Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms