Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr4P70658 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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