Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux2P70298 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux2P70298 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux2P70298 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux2P70298 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux2P70298 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cux2P70298 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cux2P70298 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cux2P70298 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms