Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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