Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf5P70191 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf5P70191 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf5P70191 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf5P70191 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf5P70191 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf5P70191 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms