Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
SbdsP70122 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbdsP70122 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms