Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SnrpfP62307 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms