Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms