Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PlnP61014 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PlnP61014 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PlnP61014 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PlnP61014 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PlnP61014 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PlnP61014 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PlnP61014 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PlnP61014 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PlnP61014 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PlnP61014 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PlnP61014 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PlnP61014 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PlnP61014 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PlnP61014 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PlnP61014 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PlnP61014 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PlnP61014 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PlnP61014 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PlnP61014 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.3 ms