Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap25P60879 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap25P60879 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms