Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CirbpP60824 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms