Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Setd4P58467 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Setd4P58467 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd4P58467 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms