Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Bace1P56818 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 281.9 ms